潔凈室起源于醫療行業，發展于微電子行業。隨著科學技術的進步，科研生產過程中，對于環境空氣的潔凈度的要求越來越高。應用潔凈室的行業也越來越多。目前，微電子、光電子、醫藥、醫療、微生物、儀器、儀表、航天、航空、食品、保健品、化妝品等行業，都廣泛地使用潔凈室。然而，由于種種原因，應用潔凈室存在一些誤區。現就常見的誤區說明如下：
1、要我用，不是我要用
這種現象在儀表、食品、醫藥、保健品、化妝品等行業存在較多。
有些潔凈室的使用者不知道為什么要用潔凈室，也不知道對潔凈室有什么要求，更不知道如何才能達到這些要求。只知道是技術標準或管理部門的要求。為了獲得生產許可證，或者為了應付檢查，而建造應用潔凈室。結果潔凈室是有其名無其實。
2、驗收合格，萬事大吉
有人以為：潔凈室驗收合格，就萬事大吉了。其實不然。潔凈室的竣工驗收，多數是在空態條件下進行，測得的潔凈度是空態條件下的潔凈度。動態條件下的潔凈度才是影響科研生產的潔凈度。動態條件下的潔凈度有可能與空態條件下的潔凈度*不同。動態條件下影響潔凈度的因素很多，例如：工作人員的污染，生產設備的污染，生產原料的污染，生產工藝的污染等等。所以，要分析、研究、控制污染源。將動態條件下的潔凈度控制在工作允許的范圍之內。為了防止系統變化，還要經常進行監測，及時發現問題，及時解決問題。
3、只使用，不監測
有人是只使用，不監測，這是很危險的。污染源散發的污染，有可能影響產品質量與合格率。過濾材料有可能破裂漏氣，影響潔凈度。
送風量改變，有可能影響潔凈度。管理不當，有可能影響潔凈度。外界條件變化，也有可能影響潔凈度。所以，應有潔凈室應該經常檢測潔凈室的潔凈度。一般的潔凈室需要定期檢測，有的需要一天檢測一次；有的需要一個星期檢測一次；有的需要一個月檢測一次。具體檢查周期應該根據潔凈室的潔凈等級確定。一般潔凈等級高的潔凈室，檢測的周期要短。要求高的潔凈室需要連續檢測，保證潔凈室每時每刻都能達到需要的潔凈度。
4、只保產品，不保人
有害還是無害，對于產品與對于人是不一樣的。有些物質對于產品有害，對于人無害；也有一些物質對人有害，對產品無害。例如：氯化鈉，對人沒有多大危害，對于微電子危害很大。生產過程中產生的毒氣，對于產品影響不大，對于生產工人的身體健康影響很大。
傳統的潔凈室，對于產品的保護考慮較多，對于生產工人身體健康的保獲考慮較少，甚至沒有考慮。人是*寶貴的，應用潔凈室應該認真考慮保護工作人員的身體健康，不能只考慮保護產品的質量與合格率。一般的潔凈室新鮮空氣只占總送氣量的百分之30。
如果生產過程中，散發較多的有害氣體，可以采取以下措施：
（1）增加送氣量；
（2）增加新鮮空氣的比例；
（3）控制有害氣體的散發；
（4）設置專門排氣設施，將散發有害氣體的污染源散發的氣體直接排出室外；
（5）安裝空氣凈化裝置，去除有害氣體。電子行業、制藥行業、化妝品行業散發的有害氣體較多，這些氣體對人體的危害較大，注意保護人體健康更加重要。
5、一個污染源，污染整個潔凈室
有的公司花費大量的錢建造潔凈室，由于生產設備的一個污染源處理不當，污染物散發到整個潔凈室，致使整個潔凈室喪失了潔凈功能。這是吃力不討好的做法。對于生產設備嚴重的污染源，應該花大力氣，單獨處理，單獨排氣。另外，應盡可能使用低污染的生產設備，盡可能使用低污染的生產原料。
6、只管工作服，不管身上的塵
檢驗表明，工作人員是潔凈室的主要污染源。潔凈室的工作服，是防止人體污染物散發的主要手段。不同的潔凈度，對工作服有不同的要求。醫藥潔凈室對潔凈度的要求不高，工作服不是密封的，工作人員內衣與身體上的微粒容易散發到潔凈室的空氣中，從而降低了潔凈室的潔凈度。工作人員內衣上的灰塵是主要污染源。工作人員身上的皮屑也是主要污染源。人員內衣與身體散發到潔凈室空氣中的微粒中有許多大微粒，對于產品的影響很大。所以，醫藥潔凈室不僅對于工作服的潔凈度與殺滅細菌有較嚴格的要求，而且，對于工作人員的內衣與身體的清潔也應該有較高的要求。
7、局部需要，全部凈化
有些生產工藝，只有部分區域需要處于潔凈的空氣中，全部區域凈化，就是很大的浪費。也有一些生產工藝，只有局部區域需要別的凈化。一般部分僅需要一般級別的凈化。如果全部采用別的凈化，也會造成很大的浪費。一般潔凈室都使用過濾器，控制風量或控制風向，就可以控制局部的潔凈度，達到節省開支的目的。
8、只使用，不管理
有些單位，對潔凈室是只使用，不管理。其實，灰塵積累、生產設備污染、原料污染、工作人員污染、風量減少、過濾器漏氣等因素，都會降低了潔凈室的潔凈度。致使產品質量下降，合格率降低。所以，為了保證產品質量，提高產品的合格率，應該加強潔凈室的管理。一般情況，潔凈室應該指派責任心強的專人負責管理。
9、有人管，不會管
有些單位未有設立潔凈室的專門管理人員。有些單位雖然設立潔凈室的管理人員，然而，對管理人員沒有技術要求。潔凈室的管理人員，沒有潔凈室管理的專業知識。潔凈室的管理人員，不知道如何管好潔凈室。管理人員不學習，不提高，單憑經驗辦事。設立不會管理的管理員，等于不設。
10、想管好，權不夠
為了應付檢查，多數單位設立潔凈室管理員。管理人員也想將潔凈室管理好。然而，往往管理人員沒有管理實權，發現問題，沒有否決權。單位領導對于潔凈的重要性認識不足，不支持管理人員的意見，致使潔凈室管理員形同虛設。